Зимняя Экологическая Школа (ЗЭШ) проводится во время зимних школьных каникул (2-10 января) в Московской или ближайших к Москве областях. Участники ЗЭШ проживают в здании школы. Питание участников Школы организует школьная столовая. Лекционные занятия проводятся в здании школы. Также организуются экскурсии, прогулки и развлечения на свежем воздухе.
Учебная программа, как и в Летней Школе, состоит из обязательных занятий и большого количества разнообразных факультативов. Из-за того, что зимние каникулы составляют всего 10 дней, учебный цикл на зимней школе один.
ЗЭШ 2012